Το Τμήμα Αρχιτεκτόνων του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας, οργανώνει και λειτουργεί:

1. το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών "Μετα-βιομηχανικός Σχεδιασμός"
2. το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών "Επαναχρήσεις κτιρίων και συνόλων"
3. το Διαπανεπιστημιακό Διατμηματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών "Τεχνολογίες της Πληροφορίας και της Επικοινωνίας για την Εκπαίδευση", με τη συνεργασία του Τμήματος Εκπαίδευσης και Αγωγής στην Προσχολική Ηλικία του Πανεπιστημίου Αθηνών, του Τμήματος Επικοινωνίας και Μέσων Μαζικής Ενημέρωσης του Πανεπιστημίου Αθηνών και του Τμήματος Ηλεκτρολόγων & Ηλεκτρονικών Μηχανικών του Πανεπιστημίου Δυτικής Αττικής.

Επίσης, στο Τμήμα εκπονούνται:

• Διδακτορικές Διατριβές, κανονισμός εκπόνησης Διδακτορικής Διατριβής
• Μεταδιδακτορικές Έρευνες, κανονισμός εκπόνησης Μεταδιδακτορικής Έρευνας 2020.